Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms