Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms