Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms