Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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