Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms