Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms