Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20809Q62458 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20809Q62458 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms