Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp4Q62445 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms