Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms