Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TrhQ62361 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TrhQ62361 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrhQ62361 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms