Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
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Kdm5dQ62240 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5dQ62240 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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