Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms