Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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