Protein–RNA interactions for Protein: Q61851

Fgfr3, Fibroblast growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr3Q61851 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfr3Q61851 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfr3Q61851 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms