Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EsrrbQ61539 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EsrrbQ61539 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EsrrbQ61539 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EsrrbQ61539 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EsrrbQ61539 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EsrrbQ61539 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EsrrbQ61539 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms