Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1aQ61495 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms