Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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