Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms