Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms