Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Trim38Q5SZ99 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim38Q5SZ99 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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