Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms