Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms