Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms