Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms