Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf215Q5SPX3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms