Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms