Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav8d-2Q5R1B6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trav8d-2Q5R1B6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms