Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms