Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms