Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms