Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms