Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms