Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms