Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms