Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rtl5Q5DTT4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtl5Q5DTT4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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