Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms