Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms