Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms