Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms