Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn13Q3UW68 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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