Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb48Q3UW22 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb48Q3UW22 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms