Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms