Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-Eb2Q3UUV9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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