Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec31aQ3UPL0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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