Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms