Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms