Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms