Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms