Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VwceQ3U515 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms