Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms